La fenêtre a trois volets : la barre latérale à gauche, la liste des notes au milieu et la note ouverte à droite.
Fichier ▸ Nouveau (Ctrl+N) ou le bouton + au-dessus de la liste crée une note en haut de la liste. La première ligne d'une note est son titre. Paragraph enregistre chaque note tout seul ; Fichier ▸ Enregistrer… (Ctrl+S) l'enregistre tout de suite.
Cliquez sur une note pour l'ouvrir. Shift+clic et Ctrl+clic sélectionnent plusieurs notes. Un double-clic ouvre la note dans sa propre fenêtre. Un clic droit sur une note propose Étoile, Corbeille et les couleurs. Cliquez sur le titre au-dessus de la liste pour choisir l'ordre : Date de modification, Date de création, Titre (A–Z) et Notes avec étoile en premier.
La barre latérale montre Notes, Récentes, la Corbeille, les couleurs, les tags et les notes avec étoile. Affichage ▸ Barre latérale (Ctrl+Shift+M) l'affiche ou la masque ; Affichage ▸ Barre latérale étendue (Ctrl+Alt+Shift+M) montre les noms à côté des icônes. Faites glisser des notes sur une couleur ou un tag pour leur donner cette couleur ou ce tag.
Le menu Couleurs donne aux notes sélectionnées l'une des onze couleurs. Écrire #mot dans une note ajoute le tag mot ; un clic droit sur un tag dans la barre latérale permet de le renommer ou de le supprimer.
La loupe au-dessus de la liste (Ctrl+F quand la liste est au premier plan) cherche dans les titres et le texte de toutes vos notes.
Corbeille déplace une note dans la Corbeille ; dans la Corbeille, Récupérer la ramène.
Aide ▸ Créer des notes d'exemple… ajoute quelques notes qui montrent ce que Paragraph sait faire. Vos propres notes ne sont pas modifiées.